Отделните атоми могат да се обединяват, като по този начин образуват нови частици, наречени молекули.

Молекулата е най-малката частица от дадено вещество, способна на самостоятелно съществуване, и е носител на основните му свойства. Представлява повече или по-малко устойчиво съчетание от определен брой еднакви или различни атоми, свързани помежду си чрез химични връзки. Свойствата на молекулите се определят от техния състав и строеж, т.е. от вида, броя и начина на свързване един с друг на изграждащите ги атоми. Съставът и строежът на молекулите се изразяват съкратено посредством химически формули. Молекулната формула показва една молекула от просто вещество или химично съединение кои елементи съдържа молекулата и какъв е броят на атомите им в нея, но не и химичните връзки. От молекули са изградени част от простите вещества и всички хомеополярни съединения. Вещества, чиито молекули са съставени най-много от 1000 атома, се наричат нискомолекулни, а тези с по-многоатомни молекули - високомолекулни. Превръщането на един вид молекули в друг се нарича химическа реакция.

Йоните са частици, които се получават от атоми или от молекули чрез отдаване или присъединяване на електрони. Когато от електронеутрален атом или молекула се отделят електрони се получава се йон с положителен заряд положителен йон. Когато пък електрони се присъединят към атом или молекула, се получава йон с отрицателен заряд отрицателен йон. Йоните участват в изграждането на кристалната решетка на някои вещества.

Свойствата на веществата зависят от техния състав, строеж и от движенията на градивните частици.

Макросвят

Главните съставни компоненти на микросвета атоми и молекули участват в израждането на заобикалящите ни тела. Свойствата на тези тела се определят от движението и взаимодействието на израждащите ги частици. Различното взаимодействие между градивните частици причинява и различни свойства на изградения от тях предмет.

Движението и взаимодействието на макротелата се определя от общовалидни физични закони. С тези закони се занимава науката механика и нейните подраздели на твърдите тела и на флуидите (течности и газове). Други дялове на механиката са кинематиката, която изучава законите на движението и покоя на телата, динамиката, разглеждаща причините и силите, които предизвикват това